Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PTPRBP23467 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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