Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACO1P21399 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACO1P21399 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms