Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDSP20132 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDSP20132 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SDSP20132 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SDSP20132 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms