Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPCAMP16422 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPCAMP16422 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPCAMP16422 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms