Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BMP3P12645 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BMP3P12645 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms