Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms