Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F9P00740 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F9P00740 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F9P00740 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms