Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ACSL4O60488 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ACSL4O60488 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ACSL4O60488 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ACSL4O60488 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ACSL4O60488 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ACSL4O60488 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ACSL4O60488 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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