Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB3O43889 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms