Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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KDELR3O43731 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KDELR3O43731 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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