Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms