Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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USP15Q9Y4E8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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