Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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