Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRDM5Q9NQX1 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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