Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZCCHC17Q9NP64 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms