Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM5Q9C035 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms