Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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SPOCK3Q9BQ16 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SPOCK3Q9BQ16 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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SPOCK3Q9BQ16 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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SPOCK3Q9BQ16 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SPOCK3Q9BQ16 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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SPOCK3Q9BQ16 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SPOCK3Q9BQ16 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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SPOCK3Q9BQ16 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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