Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNFT2Q96EX2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms