Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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