Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP3Q8WYN3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms