Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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