Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms