Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWISTNBQ3B726 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms