Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UVSSAQ2YD98 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms