Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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