Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC37Q16543 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC37Q16543 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms