Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms