Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms