Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms