Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IHHQ14623 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms