Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LAMB3Q13751 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms