Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANK3Q12955 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms