Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms