Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms