Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms