Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC01547P58512 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC01547P58512 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms