Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms