Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH1A3P47895 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms