Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms