Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MCAMP43121 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MCAMP43121 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MCAMP43121 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms