Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms