Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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