Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PTPRBP23467 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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