Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGB6P18564 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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