Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAV1P15498 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms