Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMP3P12645 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BMP3P12645 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BMP3P12645 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMP3P12645 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BMP3P12645 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms