Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms