Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
APELAP0DMC3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms