Protein–RNA interactions for Protein: O60645

EXOC3, Exocyst complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC3O60645 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EXOC3O60645 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms