Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DENRO43583 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DENRO43583 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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